科学家把基因网络视作社交网络辨别疾病节点
关键字： 基因网络 疾病节点
时间： 2016-03-17 16:08:48
不同的疾病和成千上万的基因变体是有联系的，但是这些变体仍然保持着它们最诡谲的秘密——对于疾病进程参与的机制。关键是这些机制通常涉及多个参与者—基因,转录因子,增强剂,促进剂。如果能够了解这些网络的运作，我们就有可能开发出更好的诊断测试以及为病人提供个性化的治疗。
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这种可能性大大地激发瑞士生物信息学研究所的研究员去采用以网络为中心的角度去进行全基因组关联研究(GWAS)分析。更重要的是，研究人员通过世界的社交网络得到的灵感来进行分析。研究员尝试去寻找分子监管途径了解疾病的基因“影响者”，而不是去了解社交网络用户的相互关系。
而一个新的软件工具，如路径评分算法(Pascal),可以让科学家们建立精确的基因网络“地图”包含了约400种不同的人类细胞和组织类型,从免疫细胞到大脑组织,而以前的研究都局限于一个或几个组织。每一个网络表达了成千上万的调节反应在这些基因之间的相互作用，在不同的细胞和组织里展示出一个直观全局视图的“控制系统”。
这项研究的内容出现在最近的两篇文章,其中1月25日发表在PLOS计算生物学(“快速和严格的基因和通路分数计算SNP-Based汇总统计”),和另一篇发表在3月7日的《自然方法(“组织监管电路模块化揭示变量扰动在复杂疾病”)。这些文章描述瑞士的研究人员合作研究人员广泛的麻省理工学院和哈佛大学,发现基因变异影响组件特定疾病组织的监管网络,提供了新的见解对疾病机制,可能导致有针对性的治疗,对病人更有效和更少的副作用。
“帕斯卡是设计为快速、准确和高功率检测相关的通路,”PLOS计算生物学的文章的作者写道。“我们广泛测试方法在大量的真实GWAS协会,看到更好的发现结果比与其他流行的方法确认的途径。”
在《自然方法》文章中,研究员对于研究有了更进一步的发展，他们进行了摄动分子电路构成的映射复杂的疾病。
“我们的工作表明,基因网络在不同组织的精确的地图将巨大的价值促进了我们对疾病的启动和进展,”斯文伯格曼博士这两项研究的资深作者。“这样的理解是至关重要的设计有针对性的治疗方法和识别患者组织应对这些治疗在个性化医疗环境。”
